We'll benchmark a representative request to get an initial idea.

index.php
<?php
require_once "config.inc";
require_once "model.inc";
require_once "utils.inc";
require_once "head.inc";
head();
foreach(articles() as $row) {
  $name = upper($row['name']);
  echo <<<EOB
<tr>
<th>$name</th><td>{$row['age']}</td><td>{$row['entry']}</td>
</tr>
EOB;
}
boo();
foot();
?>
config.inc
<?php
$config = array(
  'db'      => 'pgsql',
  'db_user' => 'nobody',
  'db_pwd'  => 'foobar',
  'db_host' => 'localhost',
  'db_db'   => 'users',
  'db_opts' => array(PDO::ERRMODE_EXCEPTION => true)
);
?>
model.inc
<?php
function articles() {
  global $config;
  try {
    $dbh = new PDO($config['db'].':host='.$config['db_host'].';dbname='.$config['db_db'],
                   $config['db_user'],$config['db_pwd'], $config['db_opts']);
    $q = "select users.name, users.age, data.entry 
          from users,data where data.name = users.name";
    $result = $dbh->query($q,PDO::FETCH_ASSOC);
  } catch (PDOException $e) {
    echo "Error!: " . $e->getMessage();
    die();
  }
  return $result;
}
?>
head.inc
<?php
function head() {
?>
<html><head><title>Index</title></head>
<body>
<table>
<?php
}

function foot() {
?>
</table></body></html>
<?php
}
?>
utils.inc
<?php
function upper($arg) {
  return strtoupper($arg);
}
function boo() {
  echo "boo";
}
?>